农业大数据学报 ›› 2025, Vol. 7 ›› Issue (1): 112-117.doi: 10.19788/j.issn.2096-6369.100022
武亚敬1(), 冀晓昊2, 于祎飞1, 时梦2, 王孝娣2, 王宝亮2, 刘凤之2, 李明亮3, 王贺3, 刘俊1,*(
), 王海波2,*(
)
WU YaJing1(), JI XiaoHao2, YU YiFei1, SHI Meng2, WANG XiaoDi2, WANG BaoLiang2, LIU FengZhi2, LI MingLiang3, LI He3, LIU Jun1,*(
), WANG HaiBo2,*(
)
摘要:
中国在全球葡萄产业中占据重要地位,栽培面积和产量均居世界前列。作为果树产业的关键分支,葡萄产业对于农民的增收和乡村振兴起到了支柱作用。国外品种的引进和自主培育极大地丰富了我国的葡萄品种储备,为产业发展奠定了基础。但品种增多也带来了品种同质化及鉴定困难,传统的形态特征鉴定方法已不再适应当前的需求。本研究对291份鲜食葡萄种质资源提取DNA,利用30对荧光标记的SSR分子标记进行了PCR和荧光毛细管电泳检测,构建品种分子指纹图谱。本研究构建的分子指纹图谱数据库共包含8 730条信息,进一步分析表明,所选用的30个引物位点平均基因型个数为10.7个,杂合度范围为0.21到0.62,平均杂合度为0.38。依据30个引物位点基因型个数,216个品种被推测为二倍体,75个为多倍体,发现二倍体品种间的相似度普遍较低,而多倍体品种的相似度则相对较高。这项研究的成果不仅为葡萄品种鉴定提供了准确依据,而且为种质资源的亲缘关系分析提供了数据支撑,对葡萄产业理论研究和实际应用均具有重要意义。
数据摘要:
项目 | 描述 |
---|---|
数据库(集)名称 | 291个葡萄品种SSR分子指纹数据集 |
所属学科 | 农学,生物学 |
研究主题 | 葡萄品种SSR分子指纹 |
数据时间范围 | 2022年—2023年 |
时间分辨率 | 1年 |
数据地理空间覆盖 | 河北省张家口市怀来县 |
数据类型与技术格式 | .XLSX |
数据库(集)组成 | 本数据集由6个表格数据组成,主要包括291个葡萄品种30个引物位点的PCR产物分子量信息、30对引物的引物名称和序列信息、品种倍性推断结果、多倍体品种相似度矩阵、二倍体品种相似度矩阵和基因型频率。 |
数据量 | 299 kB |
数据可用性 | DOI:10.57760/sciencedb.agriculture.00103 CSTR:17058.11.sciencedb.agriculture.00103 |
经费支持 | 国家重点研发计划(2023YFD1200100);国家农业科技园区专项(2021C-01);山东省重点研发计划(2022TZXD0010);中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP-2021-RIP-02);怀来葡萄与葡萄酒产业科技特派团 |